Багатскіс очолив збірну України в травні 2019 року. Тоді ж він став і головним тренером клубу Київ-Баскет, поєднуючи роботу в збірній та клубі. У період з 2019 по 2022 рік з Київ-Баскетом латвієць здобув срібло та бронзу Суперліги, а також двічі виводив команду до плей-офф Кубка Європи ФІБА.
Варте уваги Українець Михайлюк став найкращим гравцем на Євробаскет-2022 за одним з показників
Під керівництвом латвійця збірна з першого місця відбіркової групи вийшла у фінальну частину чемпіонату Європи. На Євробаскеті-2022 збірна України посіла друге місце в групі, здобувши три перемоги у п’яти матчах: над Великою Британією, Естонією та Італією, а в 1/8 фіналу поступилася збірній Польщі.
Після закінчення виступу на чемпіонаті Європи, Багатскіс заявив, що його контракт що з клубом, що зі збірною закінчився. Тому була невизначеність у тому, хто продовжить роботу в збірній України.
3 жовтня Київ-Баскет оголосив, шо новим тренером команди став Володимир Холопов.
16 жовтня Федерація баскетболу України заявила, що Айнарс Багатскіс продовжить роботу з національною командою. Його контракт діятиме до закінчення кваліфікації чемпіонат світу 2023
Українська збірна продовжує виступ у відборі на чемпіонат світу. В рамках другого етапу кваліфікації наша команда наразі має одну перемогу в шести матчах.
В наступному ігровому вікні національна команда 11 листопада на виїзді протистоятиме Нідерландам, а 14 листопада гратиме проти збірної Ісландії. Ще два матчі команда проведе в лютому 2023 року. Спочатку 23 лютого зіграє на виїзді проти Італії, а після цього 26 лютого прийматиме вдома Нідерланди.