Пернер фінішував третім у 10-кілометровому спринті на Олімпійських іграх 2002 в американському Солт-Лейк-Сііті. Це була перша медаль для Австрії у біатлоні. на Олімпіадах. Через чотири роки на змаганнях у Турині Пернер став четвертим у спринті. Однак тоді під час обшуку в нього виявили заборонені препарати. Його і інших членів збірної Австрії дискваліфікували.
Читайте також: Неочікувано помер триразовий олімпійський чемпіон з біатлону Хальвард Ханевольд
Після цього Пернер признався у використанні допінгу. Через це його умовно дискваліфікували на 18 місяців арешту, а також штрафу на 23 тисячі євро. Пернер же одразу закінчив кар'єру.
Помер Пернер 1 жовтня після тривалої хвороби. Йому було 52 роки. У нього залишилася дружина та двоє дітей.